Seiring dengan perkembangan dan dinamika berbagai kegiatan Perguruan Wali Suci Indonesia Cabang Kutai Timur - Kaltim, maka tidak terasa telah sampai pada akhir peroidisasi kepengurusan dalam dekade pertama. Rentang waktu tahun kepengurusan tahun 2003 sampai 2012 telah banayak kegiatan dan aktivitas perguruan yang selayaknya dicatat maupun dievaluasi dalam periode ini, sehingga saatnya untuk kembali berkumpul dan bermusyawarah menentukan haluan oranisasi kedepan.
Kegiatan Musyawarah Cabang ke-3 Perguruan Wali Suci Indonesia Kabupaten Kutai Timur yang dilaksanakan pada tanggal 20 Januari 2013 H. atau 09 Rabiul Awal 1434 H. di Hotel Jamrud Sangatta Utara telah menelurkan berbagai konsep guna kesiapan organisasi menapak berbagai kegiatan kedepan. Hasil dari kegiatan ini diharapkan mampu meningkatkan potensi keilmuan bagi para anggota yang ada di daerah ini.
Tema yang diusung dari kegiatan ini adalah : "Meretas Loyalitas Persinalia Anggota terhadap Perguruan Wali Suci untuk Kemajuan Organisasi, Pengamalan dan Pengembangan Keilmuan dan Pengabdian" adalah rangkaian upaya peningkatan kompetensi anggota dalam memahami peran perguruan dalam kehidupan sehari-hari.
Peserta dalam kegiatan ini adalah seluruh anggota Perguruan Wali Suci Indonesia Cabang Kutai Timur yang terdiri dari beberapa anggota dari Komisariat. Para peserta berperan serta dalam merumuskan program kerja selama satu periode, mengeluarkan rekomenasi organisasi dan memilih dan menentukan pengurus baru pada masa bakti selanjutnya.
Hasil Musyawarah Cabang ke-3 Perguruan Wali Suci Indonesia Kabupaten Kutai Timur ini berhasil memilih secara demokratis saudara Yajis Paggasa, M.Si sebagai Ketua Umum sekaligus Ketua Formatur dengan menyisihkan lima kanditat yang diajukan oleh peserta Musyawarah Cabang.
